ศูนย์วิจัยทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่งอ่าวไทยตอนล่าง ก่อตั้งขึ้นจากการแบ่งส่วนราชการใหม่ อยู่ภายใต้กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม ซึ่งเป็น 1 ใน 6 กระทรวงใหม่ ที่เกิดจากการปฏิรูประบบราชการของรัฐบาล ตามประกาศในราชกิจจานุเบกษา เมื่อวันที่ 8 ตุลาคม 2545 เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการบริหารราชการแผ่นดิน และเพื่อบูรณาการงานในด้านต่างๆ ที่เกี่ยวข้องให้ได้ประสิทธิผลอย่างมีเอกภาพ
เดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2555 ได้เปลี่ยนชื่อหน่วยงานเป็น ศูนย์วิจัยและพัฒนาทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่งอ่าวไทยตอนล่าง
(Marine and Coastal Resources Research and Development Center, Lower Gulf of Thailand)
วันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2562 ได้เปลื่ยนชื่อหน่วยงานเป็นชื่อเดิม คือ ศูนย์วิจัยทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่งอ่าวไทยตอนล่าง
(Marine and Coastal Resources Research Center, Lower Gulf of Thailand)
ชื่อย่อภาษาไทย : ศวทล.
ละติจูด 7.1676279 ลองจิจูด 100.5868294